Ученые из Кембриджского университета (Великобритания) создали атлас белков, описывающий их поведение внутри клеток. Инструмент, который может помочь в поиске истоков заболеваний, связанных с неправильным поведением белков, опубликован в журнале Nature Communications.
Атлас позволил найти новые белки внутри клеток, которые отвечают за ряд важных функций организма. Ученые сосредоточились на конденсате — каплевидной части клетки, которая является местом встречи и организации белков, а также ключевым местом, где начинаются процессы заболевания.
Авторы работы отмечают, что эта модель позволила обнаружить новые компоненты в безмембранных компартментах в биологии и открыть новые принципы их функционирования. Клетки состоят из тщательно организованных молекул, и один из методов, с помощью которого они организуют себя — встреча внутри конденсата.
До сих пор не существовало полной карты того, какие белки объединяются в конденсаты. Правила, управляющие белками внутри клеток, до конца не изучены, поэтому ученые решили создать атлас, чтобы предсказать, какие белки встречаются в конденсатах. Они использовали базы данных, которые содержат данные о многих аспектах клеток, а также более глубокие тематические исследования отдельных конденсатов, и объединили их при помощи нейросетей.
Если в предыдущих работах основное внимание уделялось нескольким белкам, то атлас позволяет охарактеризовать весь ландшафт клетки. С его помощью можно делать прогнозы относительно каждого отдельного белка в клетке: где именно он будет обнаружен, с какими белками взаимодействует. Авторы надеются, что это откроет новые возможности для борьбы с заболеваниями, связанными с неправильным образованием конденсата.
